乡镇卫生院在开具克唑替尼这一靶向药物方面确实面临一些挑战。克唑替尼主要用于治疗ALK阳性和ROS1阳性的非小细胞肺癌（NSCLC）。由于克唑替尼是一种处方药，患者需要在医生的指导下使用，而乡镇卫生院可能因为资源和专业能力的限制，难以提供相应的诊断和治疗服务。

克唑替尼治疗的突变类型主要是ALK（间变性淋巴瘤激酶）阳性和ROS1（ROS proto-oncogene 1）阳性的突变。这两种突变在非小细胞肺癌患者中较为罕见，但克唑替尼能有效抑制这些突变引起的肿瘤生长。

对于乡镇卫生院的患者来说，如果需要使用克唑替尼，可能需要到更高级别的医院进行确诊和处方。确诊后，患者可以依据医保政策进行报销。克唑替尼已被纳入医保报销范围，属于医保乙类药品，报销比例一般在50%到70%之间，具体比例依据地区政策有所不同。患者在购买克唑替尼时，需要准备个人身份证明、诊断证明、医生处方等相关资料作为报销凭证。

可以说，乡镇卫生院在开具克唑替尼方面存在局限，患者可能需要到更专业的医疗机构进行诊断和治疗，并依据当地医保政策进行克唑替尼的报销。